1、呼吸衰竭与呼吸道感染 这是颈脊髓损伤的严重并发症。人体有胸式呼吸与腹式呼吸两组肌肉，胸式呼吸由肋间神经支配的肋间肌管理，而腹式呼吸则来自膈肌的收缩。
膈神经由颈3、4、5组成，颈4是主要的成分，颈脊髓损伤后，肋间肌完全麻痹，因此伤者能否生存，很大程度上取决于腹式呼吸是否幸存。颈1、2的损伤往往是伤者在现场即已死亡。颈3、4的损伤由于影响到膈神经的中枢，也常于早期因呼吸衰竭而死亡。即使是颈4-5以下的损伤，也会因伤后脊髓水肿的蔓延，波及中枢而产生呼吸功能障碍，只有下颈椎损伤才能保住腹式呼吸。
由于呼吸肌力量不足。呼吸非常费力，使呼吸道的阻力相应增加，呼吸道的分泌物不易排出，久卧者容易产生坠积性肺炎，一般在一周内便可发生呼吸打感染，吸烟者更是提前发生，其结果是伤者因呼吸道感染难以控制或痰液堵塞气管因窒息而死亡。
在20世纪50年代，颈椎髓损伤死亡率几乎达到100％，随着对呼吸生理认识的进展和呼吸机的不断革新，使生存率逐渐提高。气管切开可以减少呼吸道死腔，及时呼出呼吸道内分泌物，安装呼吸机进行辅助呼吸，还可以经气管给以药物；然而气管切开后为护理构成带来很大的困难，因此何时作气管切开最时宜目前尚未定论，一般认为下列病员应作气管切开；
（1）上颈椎损伤：
（2）出现呼吸衰竭者：
（3）呼吸道感染痰液不易咳出者：
（4）已有窒息者。 选用合适的抗生素与定期翻身拍背有助于控制肺部感染。
2、泌尿生殖道的感染和结石 由于括约肌功能的丧失，伤员因尿潴留而需长期留置导鸟尿管，容易发生米尿道的感染与结石男性病员还会发生副睾丸炎。
